Lipidomic profiling of plasma and erythrocytes from septic patients reveals potential biomarker candidates

FAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOSepsis remains the primary cause of death from infection, despite advances in modern medicine. The identification of reliable diagnostic biomarkers for the early detection of this disease is critical and may reduce the mortality rate as it could allow ear13113FAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOFAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOsem informação162191/2015-4The authors thank FAPESP, for financial support, the colleagues, and students of the Unidade Integrada de Farmacologia e Gastroenterologia (UNIFAG) and Laboratório de Análises Clínicas São José from Hospital Universitário São Francisco na Providência de

Plasma lipidomic signature of rectal adenocarcinoma reveals potential biomarkers

FAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCAPES - COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIORCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICORectal adenocarcinoma (RAC) is a common malignant tumor of the digestive tract and survival is highly dependent upon stage of disease at diagnosis. Lipidomic strategy can be used to identify potential biomarkers for establishing early diagnosis or therape7FAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCAPES - COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIORCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOFAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCAPES - COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIORCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICO2016/11905-2sem informação2015/162191-4The authors wish to thank their colleagues of the Unidade Integrada de Farmacologia e Gastroenterologia (UNIFAG) and Laboratório de Análises Clínicas São José from Hospital Universitário São Francisco na Providência de Deus and FAPESP (2016/11905-2) for

Case studies in oil : biodegradation and origin

Orientador: Anita Jocelyne MarsaioliTese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de QuímicaResumo: Neste trabalho avaliou-se a ação de micro-organismos em amostras de petróleo naturalmente biodegradadas e em ensaios de biodegradação realizados em laboratório, através da otimização de um protocolo que utiliza metodologias rápidas de análise da fração polar por ESI-MS. Assim sendo foi possível aferir a composição molecular dos constituintes das classes de compostos oxigenados (O, O2, O3 e O4) e nitrogenados (N, NO, NO2, NO3) presentes no petróleo e correlacioná-las ao fenômeno de biodegradação, e ambiente deposicional em óleos da Bacia de Campo e da Bacia Potiguar, respectivamente. As informações geradas nesse estudo contribuíram para o entendimento da origem dos biomarcadores ácidos através da degradação dos respectivos hidrocarbonetos. Complementando o escopo principal do trabalho foram caracterizados dos micro-organismos do petróleo por técnicas de espectrometria de massas, mostrando a importância do desenvolvimento desta técnica com construções de bibliotecas de referência e elaboração de softwares mais elaborados. Finalizando foi realizada a síntese de um biomarcador trideuterado com ampla utilização em estudos de petróleoAbstract: In this work we were able to evaluate the action of microorganisms in naturally biodegraded samples and in biodegraded laboratory assays, by optimizing a protocol that uses fast methods of analysis of the polar fraction by ESI-MS. Which was possible to determine the molecular composition of the compounds for oxygen (O, O2, O3 and O4) and nitrogen classes (N, NO, NO2, NO3) present in petroleum. Allowing to correlate those classes with the biodegradation phenomenon, and the depositional environment for the different studied petroleum samples. Even more information is generated about the origin of biomarkers acids through degradation of the respective hydrocarbons. In addition to the main scope of work, we characterize the petroleum microorganisms by mass spectrometry techniques, showing the importance of developing this MO identification technique by the construction of reference libraries and development of more sophisticated software. Also we synthesized a trideuterated biomarker widely used in studies with petroleumDoutoradoQuimica OrganicaDoutor em Ciência

Study of the microbiota and of petroleum biodegradation in Brazilian basins, and its consequences on the biodegradation parameters

Orientador: Anita Jocelyne MarsaioliDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de QuimicaResumo: O principal objetivo desse trabalho foi avaliar a biodegradação de petróleo e suas implicações nos parâmetros de correlação do óleo realizada por microrganismos isolados da Bacia de Campos (RJ) e de consórcios microbianos da Bacia Potiguar (RN). Os experimentos de biodegradação foram adaptados à escala laboratorial, a fim de mimetizar um reservatório de petróleo. O estudo das atividades enzimáticas com moléculas representantes de algumas classes de biomarcadores de petróleo revelou a existência de enzimas capazes de realizar algumas reações como as de: lipase, esterase, epóxido-hidrolase, mono e dioxidases, redutases e liases (reações de formação e/ou rompimento de ligações carbono-carbono). Atividades essas importantes na degradação do petróleo e de outras fontes de carbono. Nos experimentos com biodegradação de petróleo pôde-se perceber que os microrganismos isolados atuaram de forma diferente entre si sobre as diferentes classes de biomarcadores. De maneira geral a biodegradação dos microrganismos isolados com o óleo P1 apresentou uma preferência na seguinte ordem: hidrocarbonetos saturados > aromáticos leves > bicíclicos > terpanos tricíclicos e hopanos. Já para o consorcio avaliado, recuperado do óleo da bacia Potiguar, frente ao óleo PS1 observou-se a seguinte seqüência de biodegradação: hidrocarbonetos leves> aromáticos leves> terpanos tricíclicos. Sendo que os hidrocarbonetos mais pesados e hopanos não apresentaram uma biodegradação tão significativa. Os resultados obtidos foram importantes para concluir que alguns dos parâmetros de biodegradação utilizados em geoquímica orgânica variam muito em função do tipo de atuação da microbiota específica presente no reservatório.Abstract: The main objective of this study was to evaluate the oil biodegradation of the Pampo Sul oil field (Campos Basin , RJ) isolated microorganisms and the Potiguar Basin (RN) microbial consortia and how they affected the geochemical parameters. The biodegradation experiments of selected molecules, chosen to represent some petroleum biomarker classes, were adapted to the laboratory scale trying to mimic an oil reservoir, revealed the presence of lipases, esterases, epoxide hydrolases, mono and dioxygenases, reductases and some C-C bond cleaving and bond making (liases) enzymes. These activities are important for oil degradation and of other carbon sources. In experiments of oil biodegradation these microorganisms had a different beaviour upon each biomarker class. In general the biodegradation of microorganisms with the oil P1 showed a preference for: hydrocarbons > light aromatic > bicyclic terpanes > tricyclic terpanes and hopanes. Microorganims from Potiguar Basin oil had a different preference in biodegradation: light hydrocarbons> light aromatic > tricyclic terpanea, and the heavier hydrocarbons and hopanes showed no significant biodegradation. In conclusion, these results reveal that the geochemical parameters that are proxies of biodegradation depend on the specific microbiota in the reservoir.MestradoQuimica OrganicaMestre em Químic

Criegee mechanism as a safe pathway of color reduction in sugarcane juice by ozonation

Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)The production of crystal sugar is based on sugarcane juice clarification through sulphitation, that is, heat treatment with sulfur dioxide. The use of ozonation as an alternative to sulphitation aims to eliminate the disadvantageous presence of residual sulfite in crystal sugar. Both treatments are used to reduce color of sugarcane juice. The objective of this work was to evaluate two process parameters (temperature and pH) to reduce gallic acid, a low molecular weight pigment (MW 170 g mol(-1)) widely found in sugarcane. Gallic acid was used as a model compound in sucrose solutions. The results showed that degradation of gallic acid was favored from pH 7.0 to 7.82 and temperature values between 50 and 70 degrees C. The reaction mechanism was proposed for gallic acid degradation by ozone based on Criegee mechanism. Ozonation was an efficient method to reduce the potential low molecular weight pigment present in the sugarcane. (C) 2017 Elsevier Ltd. All rights reserved.The production of crystal sugar is based on sugarcane juice clarification through sulphitation, that is, heat treatment with sulfur dioxide. The use of ozonation as an alternative to sulphitation aims to eliminate the disadvantageous presence of residual225181187FAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)2014/03512-5; 2009/54635-1310367/2013-1The authors thank the Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP # 2014/03512-5 and 2009/54635-1) and the National Council for Scientific and Technological Development (CNPq # 310367/2013-1) for financial support and grant for J.A.S.S.

Plasma Lipidomic Signature of Rectal Adenocarcinoma Reveals Potential Biomarkers

BackgroundRectal adenocarcinoma (RAC) is a common malignant tumor of the digestive tract and survival is highly dependent upon stage of disease at diagnosis. Lipidomic strategy can be used to identify potential biomarkers for establishing early diagnosis or therapeutic programs for RAC.ObjectiveTo evaluate the lipoperoxidation biomarkers and lipidomic signature in the plasma of patients with RAC (n = 23) and healthy controls (n = 18).MethodsLipoperoxidation was evaluated based on malondialdehyde (MDA) and F2-isoprostane levels and the lipidomic profile obtained by gas chromatography and high resolution mass spectrometry (ESI-q-TOF) associated with a multivariate statistical technique.ResultsThe most abundant ions identified in the RAC patients were those of protonated phosphatidylcholine and phosphatidylethanolamine. It was found that a lisophosphatidylcholine (LPC) plasmalogen containing palmitoleic acid [LPC (P-16:1)], with highest variable importance projection score, showed a tendency to be lower in the cancer patients. A reduction of n − 3 polyunsaturated fatty acids was observed in the plasma of these patients. MDA levels were higher in patients with advanced cancer (stages III/IV) than in the early stages groups and the healthy group (p < 0.05). No differences in F2-isoprostane levels were observed among these groups.ConclusionThis study shows that the reduction in plasma levels of LPC plasmalogens associated with an increase in MDA levels may indicate increased oxidative stress in these patients and identify the metabolite LPC (P-16:1) as a putatively novel lipid signature for RAC

A comprehensive characterization of solanum lycocarpum St. Hill and solanum oocarpum sendtn: chemical composition and antioxidant properties

CNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOFAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCAPES - COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIORIn this study we evaluated the proximate composition of two Solanaceae fruits from Brazilian Cerrado, their mineral content, volatile organic compounds (VOCs), phenolic compounds profile, and antioxidant capacity employing Oxygen Radical Absorbance Capaci1246169CNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOFAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCAPES - COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIORCNPQ - CONSELHO NACIONAL DE DESENVOLVIMENTO CIENTÍFICO E TECNOLÓGICOFAPESP - FUNDAÇÃO DE AMPARO À PESQUISA DO ESTADO DE SÃO PAULOCAPES - COORDENAÇÃO DE APERFEIÇOAMENTO DE PESSOAL DE NÍVEL SUPERIOR141980/2016-82015/50333-12017/10753-700